В 1941 г. Муса Джалиль был призван в Красную Армию. В звании старшего политрука воевал на Ленинградском и Волховском фронтах, был корреспондентом газеты «Отвага» 2-й ударной армии.

26 июня 1942 г. в ходе Любанской наступательной операции у д. Мясной Бор Муса Джалиль был тяжело ранен в грудь и попал в плен. Прошел через фашистские лагеря в Польше, Прибалтике, Германии.

Находясь в немецком плену, принимал активное участие в деятельности подпольной группы татарских военнопленных, созданной Г. Курмашем, был ее идейным вдохновителем. По заданию этой группы работал в организации «Tatarische Mittelstelle» («Татарское посредничество», Берлин), созданной немцами для проведения пропагандистской работы среди военнопленных татар с целью вовлечения их в так называемый «Волго-татарский легион» и использования в войне против СССР; вел культурно-просветительскую работу среди насильственно зачисленных в легион военнопленных и подрывную работу против гитлеровцев. Вместе с десятью товарищами по подполью казнен в фашистской тюрьме Плетцензее. Мусе Джалилю присвоено звание Герой Советского Союза посмертно (1956).