Йонас Марцинкявичюс печатался с 1925 г. Автор реалистических романов «Беньяминас Кордушас» (1937), «Он должен умереть» (1937), «Неман разлился» (1939) и др. Автор рассказов (сборник «Серебряные колокола» 1938), очерков.

Во время войны опубликовал сборники рассказов и очерков «Отомщу» (1942), «Звезда» (1943), повесть «Настоятель Моркунас» (1943).

В послевоенные годы выступил как драматург, автор пьес «Каволюнасы» 1947; «Возвращение» 1947, написал повесть «Аудроне Нормантайте» 1950. В творчестве советского времени отражены борьба литовского народа против фашизма в годы войны, послевоенное колхозное движение в литовской деревне, рост советской литовской интеллигенции. После войны сотрудничал с литовскими газетами „Tėvynė šaukia“, „Tiesa“, „Tarybų Lietuva“. С 1945 г. жил в Вильнюсе, работал в газетах „Tiesa“ («Правда»), „Valstiečių laikraštis“ («Крестьянская газета»), „Literatūra ir menas“ («Литература и искусство»). Автор статей, очерков и эссе на различные темы жизни республики.