В декабре 1941 г. по собственной просьбе был отправлен в действующую армию на фронт. В 1942 г. воевал подо Ржевом в составе 132-ой стрелковой бригады. Помощник командира взвода отдельного стрелкового батальона, сержант Кондратьев приказом ВС 30-й армии Калининского фронта №12/н от 26.04.1942 г. был награжден медалью «За отвагу» за то, что 7 апреля 1942 г. в бою за деревню Овсянниково (ныне не существует) после гибели командира взвода под ураганным огнем противника поднял бойцов в атаку. Согласно наградному листу, в этом бою лично Кондратьевым из стрелкового оружия было уничтожено 12 немецких солдат, а броском гранаты он вывел из строя станковый пулемет противника. В этом бою Кондратьев был ранен. После отпуска по ранению служил в железнодорожных войсках, был снова тяжело ранен, в госпитале пробыл на излечении полгода, комиссован с инвалидностью.

Награды: орден Отечественной войны I степени, медаль «За отвагу», медаль «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941–1945 гг.».